Udało nam się w trakcie tychże badań odkryć cztery wejścia do krypt. Dwa prowadzące do krypty głównej znajdującej się pod nawą główną i dwa prowadzące do krypt pod prezbiterium. Byli tam chowani burmistrzowie, rajcy miejscy, urzędnicy królewscy, franciszkanie, ale pochowany został także Wacław Potocki, czyli najsłynniejszy poeta polskiego baroku. Poza tym odkryliśmy bardzo dużo zabytków ruchomych - kafli piecowych, ceramiki, ale także monety XVI i XVII wieczne. 
- wylicza Paweł Kocańda - archeolog i dyrektor bieckiego muzeum
Jak dodaje, z dotychczasowej wiedzy o historii kościoła wynikało, że do podziemi prowadzi tylko jedno wejście. Nie wykluczone, że w przyszłości krypty zostaną udostępnione zwiedzającym.